1.一种分析柞蚕茧中蛋白质组的方法,其特征在于:
采取如下步骤:
1)取样:取3个质量相同的同批柞蚕茧,剥去茧衣,分别编号为a、b、c;
2)分层:将a、b、c置于去离子水中加热,将茧壳分为外层、中层、内层和蛹衬,分别记为a1、a2、a3、a4,b1、b2、b3、b4,c1、c2、c3、c4;将分层的茧层放入60℃烘箱干燥;
3)溶解:称取同一质量的不同茧层,剪碎,置于0.5wt%Na2CO3溶液中,调节pH11~12,
130℃下水热反应4~6h,冷却后,离心除去未完全溶解部分,得到蚕丝蛋白溶液的粗产物;
4)纯化:将蚕丝蛋白溶液在4℃条件下蚕丝蛋白溶液的粗产物经过截留分子量为1000的膜透析24h,得到蚕丝蛋白溶液;
5)冷冻干燥:将蚕丝蛋白溶液在-30~-10℃的低温中冷冻,经真空冷冻干燥后得到蚕丝蛋白粉末;
6)SDS-PAGE凝胶电泳:蚕丝蛋白粉末溶于CB 9.6缓冲液中,得到20μg/μL的溶解液;取5~10μL溶解液,加入等体积的上样缓冲液,在100℃条件下加热10min,冷却至室温后,将各样品和蛋白Marker加入10%~15%聚丙烯酰胺凝胶中,进行电泳实验,所述聚丙烯酰胺凝胶包括分离胶和浓缩胶;
7)染色:电泳结束后,剥离浓缩胶,用去离子水将分离胶冲洗干净,置于固定液中固定
25~35min;除去固定液,用去离子水清洗3~5次,每次10~20min;之后将分离胶浸入考马斯亮蓝G-250染色液中,摇床染色3~5h;
8)脱色:用去离子水清洗分离胶至条带清晰,背景透明;
9)切胶脱色:将蛋白条带从分离胶上切下,置于干净的离心管中,用去离子水清洗2~3次后,进行还原和烷基化;再加入由25mM碳酸氢铵和50%乙腈配置的脱色液,超声处理,吸去脱色液后,重复一次,最后加入50~100μL乙腈,振荡脱水,待胶条变白后,吸去全部液体,冷冻干燥;
10)胶内酶解:以1:50的浴比将胶条浸没于25mM碳酸氢铵中,加入2~10μg测序级且经过修饰的胰蛋白酶,在37℃下孵育12~16h,收集提取液后,再加入20~50μL萃取液,所述萃取液为5%甲酸溶液和乙腈按体积比1:1混合,重复提取胶条中的多肽片段;将提取液冷冻干燥后,重新溶于0.1%甲酸溶液中;
11)质谱分析:进行LC-MS/MS测试,采用蛋白质定量技术测定相对定量,将不同层的蛋白质种类和含量的数据进行综合分析,比较每层中各组分的相对含量。
2.根据权利要求1所述的一种分析柞蚕茧中蛋白质组的方法,其特征在于:所述步骤2)分层时,将柞蚕茧按1:100的浴比置于去离子水中,控制温度在95±2℃,水浴加热5~
10min。
3.根据权利要求1所述的一种分析柞蚕茧中蛋白质组的方法,其特征在于:所述步骤6)凝胶电泳中,先恒压80V,10min后调整电压为120V,待样品中的溴酚蓝指示剂位于凝胶底部时,取出凝胶。
4.根据权利要求1所述的一种分析柞蚕茧中蛋白质组的方法,其特征在于:所述步骤7)染色中,固定液的配置:40mL甲醇、10mL乙酸,加去离子水至100mL;染色液的配置:将100g硫酸铵加入100mL去离子水和100mL磷酸的混合溶液中,充分搅拌至溶解完全,加入1.2g考马斯亮蓝G-250、800mL去离子水,充分搅拌后加入200mL甲醇。
5.根据权利要求1所述的一种分析柞蚕茧中蛋白质组的方法,其特征在于:所述步骤9)还原烷基化的步骤:加入500μL乙腈,处理10min后,凝胶脱水呈现不透明,快速离心,吸去液体;加入30~50μL溶于100mM NH4HCO3的10mM二硫苏糖醇溶液,覆盖全部胶条,56℃水浴
30min,冷却至室温后,加入500μL乙腈,10min后吸去全部液体;在加入30~50μL溶于100mM NH4HCO3的55mM碘乙酰胺溶液,覆盖全部胶条,室温避光20min;加入乙腈使胶条脱水后吸去全部液体。