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专利号: 2019107104682
申请人: 江南大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
专利领域: 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
更新日期:2023-10-10
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.一种检测金黄色葡萄球菌的电化学方法,其特征是:基于链置换扩增技术和三螺旋分子开关;步骤如下:首先将生物素修饰的适配体和cDNA序列高温变性,复性后在适宜温度下形成部分互补双链结构;将互补双链溶液加入链霉亲和素磁珠体系中共同孵育,通过生物素-链霉亲和素的结合使部分互补双链修饰到磁珠表面;

同时,电极上修饰包含有G四链体结构的捕获探针,与MB序列茎端互补形成三螺旋结构而捕获MB序列,此时G四链体信号关闭;在金黄色葡萄球菌存在的情况下,磁珠上部分互补双链中适配体与金黄色葡萄球菌结合,使cDNA释放;

将引物,Nb.bpu10I切刻内切酶和Bsm DNA聚合酶加入到cDNA溶液中,Bsm DNA聚合酶通过聚合反应合成完全互补的双链,Nb.bpu10I切刻内切酶在双链分子切割位点处形成切口,Bsm DNA聚合酶从断裂位点处继续合成DNA链,替换旧链,实现循环放大扩增出大量单链DNA;

该单链DNA与电极上MB序列形成完全互补序列双链,从而破坏了电极上原有的三螺旋结构,使得捕获探针释放G四链体电化学信号;建立电化学信号强度与金黄色葡萄球菌数量间线性关系的标准曲线,利用该标准曲线计算样品中的金黄色葡萄球菌含量。

2.根据权利要求1所述检测金黄色葡萄球菌的电化学方法,其特征在于具体步骤如下:(1)磁珠靶标置换系统:将1 μmol•L-1 适配体序列与1 μmol•L-1 cDNA在95℃高温变性

5min 后缓慢降温至37℃复性,形成部分互补双链;取100 μL磁珠悬液,磁性分离后用1 mL PBS缓冲液清洗3次;去除PBS缓冲液,加入200 μL部分互补双链,置于37℃摇床,220 r·min-1 孵育45 min,使部分互补双链的DNA偶联到磁珠表面;

将含有金黄色葡萄球菌的样品在3000 r·min-1离心5 min,使用PBS缓冲液清洗沉淀3次,最后重悬于PBS缓冲液;取100μL含有金黄色葡萄球菌的PBS缓冲液加入修饰有部分互补双链DNA的磁珠中,混匀,在37℃摇床中220 r·min-1孵育45 min;使用磁珠分离系统将磁珠移除体系,保留含有游离cDNA的上清液;

(2)链置换扩增体系:取上述步骤(1)溶液加入5μmol•L-1 引物序列,2.5 mmol•L-1 游离的脱氧核糖核苷三磷酸,0.0625U•μL-1 Nb.bpu10I切刻内切酶,0.025 U•μL-1 Bsm聚合酶,1×Buffer R,混匀后37℃孵育1 h;

(3)金电极三螺旋序列修饰与封闭:取粒径为0.5µm和0.05µm的氧化铝粉末分别用双蒸水分散于两块不同的抛光布上,匀速打磨直至金电极表面洁净平滑;

用0.5mol•L-1的H2SO4溶液对电极表面进行电化学清洗,其参数设置为:扫描范围-0.35~ -1.5 V,扫描速率0.1 V·s-1,样品间隔为0.01 V;

分别取0.5 μmol·L-1捕获探针和0.5 μmol·L-1MB序列混合,于37℃水浴120 min,以形成三螺旋DNA结构;将获得的混合溶液浸没金电极表面,28℃下自组装18h,然后用PBS缓冲液洗去多余DNA;立即将金电极放入1 mmol•L-1 巯基己醇MCH溶液,室温暗处反应60 min,冲洗电极;

使用电化学阻抗谱EIS检测表征每一步电极修饰情况;将电极置于0.1 mmol·L-1 [Fe

3-/4-

(CN)6]  中,扫描频率:0.1 Hz 10 kHz;

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(4)电化学信号释放:将步骤(2)链置换扩增后的混合溶液置80℃孵育20min灭活Nb.bpu10I切刻内切酶和Bsm聚合酶;然后将混合溶液浸没金电极,并在37℃孵育120min并冲洗干净;完成杂交后的金电极在G四链体形成液中浸没反应30min,确保捕获探针能够形成G四链体结构;加入0.2mmol•L-1血红素储存液至溶液中继续进行反应1h,从而得到G4-hemin复合物;提前向检测液中通入氮气30min除去氧气,之后将金电极、Ag/AgCl电极和铂丝电极分别与电化学工作站连接并浸没于除氧后的检测液中,进行DPV扫描;扫描电压-0.6  0.15V;

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(5)实际样品检测:将含有金黄色葡萄球菌的水样以步骤(1)(4)所述操作,测定出相~应的DPV峰电流值,从标准曲线中计算出相应的菌浓度。

3.根据权利要求1或2所述检测金黄色葡萄球菌的电化学方法,其特征在于:所述适配体序列如SEQ ID No.1所示; cDNA序列如SEQ ID No.2所示;引物序列如SEQ ID No.3所示;

捕获探针如SEQ ID No.4所示;MB序列如SEQ ID No.5所示。

4.根据权利要求2所述检测金黄色葡萄球菌的电化学方法,其特征在于:步骤(1)中所

3 7 -1

述含有金黄色葡萄球菌的PBS缓冲液中的菌浓度为3×10 6×10 CFU·mL 。

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5.根据权利要求2所述检测金黄色葡萄球菌的电化学方法,其特征在于:步骤(3)所述捕获探针为5’端修饰HS-(CH2)6的DNA序列。