1.一种美洲黑杨抗叶锈病的抗病基因PdGsSRK,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.一种美洲黑杨抗叶锈病的抗病基因PdGsSRK的表达蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
3.权利要求1所述的美洲黑杨抗叶锈病的抗病基因PdGsSRK的克隆引物对,其核苷酸序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示。
4.权利要求1所述的美洲黑杨抗叶锈病的抗病基因PdGsSRK在美洲黑杨抗叶锈病育种中的应用。
5.权利要求1所述的美洲黑杨抗叶锈病的抗病基因PdGsSRK在提高美洲黑杨抗叶锈病能力中的应用。
6.一种权利要求1所述的美洲黑杨抗叶锈病的抗病基因PdGsSRK的鉴定方法,包括以下步骤:(1)获取美洲黑杨基因组抗锈病目标区间序列;
(2)分别选取美洲黑杨抗叶锈病、感叶锈病品种的材料,进行锈菌接种实验,对转录组的动态表达进行分析;
(3)结合美洲黑杨抗叶锈病目标区间和转录组数据鉴定得到抗病基因PdGsSRK。
7.根据权利要求6所述的美洲黑杨抗叶锈病的抗病基因PdGsSRK的鉴定方法,其特征在于:步骤(2)中对转录组的动态表达进行分析的具体步骤为:分别提取美洲黑杨抗叶锈病、感叶锈病品种在不同接种时间点的叶片的总RNA,富集出mRNA,反转录并合成双链cDNA,经纯化后,对cDNA进行末端修复、加A并连接测序接头,构建cDNA文库,分别对应于两种对比基因型在8个不同接种时间点采集的样本,进行转录组测序;
使用RNA-seq比对软件HISAT2将clean reads对齐到参考基因组上,以比对的reads数作为每个基因的原始计数,并归一化为FPKM值,对美洲黑杨抗叶锈病、感叶锈病品种基因型在8个不同接种时期的转录组数据进行两两比较,利用EBseq R包对每个比较对中的差异表达基因进行识别。
8.根据权利要求7所述的美洲黑杨抗叶锈病的抗病基因PdGsSRK的鉴定方法,其特征在于:步骤(3)中结合美洲黑杨抗叶锈病目标区间和转录组数据鉴定抗病基因PdGsSRK具体为:对美洲黑杨抗叶锈病、感叶锈病基因型在抗性目标区间获得的差异表达基因,分析其在不同接种时间点的表达模式,得到一个诱导型R基因PdGsSRK,编码G型凝集素S受体丝氨酸/苏氨酸激酶,该基因在接种前的美洲黑杨抗叶锈病、感叶锈病基因型中均未检测到表达量,在接种后24、48和72小时,该基因在抗叶锈病基因型杨树中产生诱导型表达,而在感叶锈病基因型杨树中没有产生表达,表明PdGsSRK基因是防御锈菌浸染的特异基因。