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专利号: 202010529405X
申请人: 广西大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
专利领域: 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
更新日期:2023-12-11
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.南丹瑶鸡蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数关联SNP分子标记的筛选方法,其特征在于,包括以下操作步骤:(1)从已知文献中找出与蛋品质相关的基因,根据基因序列设计引物;取南丹瑶鸡,采血提取基因组DNA,混池后测序,检测在南丹瑶鸡上存在突变SNP位点的基因;

(2)取南丹瑶鸡母鸡作为试验鸡,从24周龄开始测定鸡蛋的蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数形状指标,每4周测1次,每次连续测3天,直到60周龄试验结束;

(3)采集60周龄试验鸡的血液并提取基因组DNA,对步骤(1)检测到的SNP位点进行多重PCR测序,收集试验鸡在SNP位点的基因型信息;

(4)整理测序数据和蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数数据,采用SAS软件将步骤(2)中检测得到的蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数数据与步骤(3)检测得到的SNP位点进行关联分析,筛选出与蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数极显著(Pr>F<0.01)关联的候选SNP分子标记。

2.根据权利要求1所述SNP分子标记的筛选方法,其特征在于:步骤(1)所述的与蛋品质相关的候选基因为ALAS1、CPOX-P6、TF、TSPO、SLC25A5和SLLCO1A2基因。

3.根据权利要求1所述SNP分子标记的筛选方法,其特征在于:与南丹瑶鸡蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数关联的SNP分子标记包括11个SNP位点,为chr9_4769768、chr9_4771619、chr9_4771623、chr9_4771738、chr9_4771779、chr9_4772495、chr4_16561900、chr4_

16561922、chr12_3351761、chr1_65234336、chr1_65234317与产蛋周期蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数关联。

4.根据权利要求3所述SNP分子标记的筛选方法,其特征在于:所述chr9_4769768位点位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有TT、TC、CC三种基因型,其中TC型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚、蛋壳强度最强,TC型个体的鸡蛋蛋形指数最佳;

所述chr9_4771619位点位于SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有TT、TC两种基因型,其中TT型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;

所述chr9_4771623位点位于SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CA两种基因型,其中CC型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;

所述chr9_4771738位点位于SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有GG、GA两种基因型,其中GG型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;。

所述chr9_4771779位点位于SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有AA、AG两种基因型,其中AA型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;

所述chr9_4772495位点位于SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CT两种基因型,其中CC型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;

所述chr4_16561900位点位于SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CG、GG三种基因型,其中GG型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;

所述chr4_16561922位点位于SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有GG、GA、AA三种基因型,其中AA型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;

所述chr12_3351761位点位于SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CT、TT三种基因型,其中TT型个体的鸡蛋蛋壳强度最强;

所述chr1_65234336位点位于SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CT、TT三种基因型,其中CC型个体的鸡蛋蛋壳强度最强;

所述chr1_65234317位点位于SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有AA、AG两种基因型,其中AG型个体的鸡蛋蛋壳强度最强。

5.一种如权利要求3或4所述南丹瑶鸡蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数关联的11个SNP分子标记,用于南丹瑶鸡的育种。

6.一种如权利要求3或4所述11个SNP位点在制备试剂盒或检测方法中的应用,其特征在于:所述试剂盒或检测方法的用途为用于南丹瑶鸡的育种。