1.一种猪的SNP标记在确定猪或猪肉中总嘌呤含量高低中的应用,所述SNP标记包括如下SNP标记中的至少一种:
(I)含有所述SNP标记的核酸的序列如SEQ ID No.1所示,所述SNP标记位于SEQ ID No.1上的从5’端起的第301位点,对应于11.1版本国际猪基因组的1号染色体上的从5’端起的第12522826位点,为C或T;
(II)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的4号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的4号染色体上的从5’端起的第39974850位点,为A或G;
(III)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的5号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的5号染色体上的从5’端起的第98167490位点,为T或C;
(IV)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第16508188位点,为G或A;
(V)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第73358830位点,为G或A;
(VI)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的7号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的7号染色体上的从5’端起的第47604014位点,为C或A;
(VII)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的9号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从5’端起的第137382277位点,为A或G;
(VIII)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的9号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从5’端起的第72327563位点,为C或A;
(IX)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的10号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的10号染色体上的从5’端起的第63740648位点,为G或A;
(X)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的13号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的13号染色体上的从5’端起的第12703401位点,为G或A;
(XI)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的14号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的14号染色体上的从5’端起的第131369424位点,为G或A;
(XII)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的15号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的15号染色体上的从5’端起的第136409919位点,为G或A。
2.一种猪的遗传改良的方法,所述遗传改良为降低猪或猪肉中总嘌呤含量,所述方法包括:确定种猪核心群中的种猪的如权利要求1中所述的SNP标记,并根据所述SNP标记做出相应的选择:
对于(I),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No.1上的从5’端起的第301位点为C/T和T/T基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因T的频率;
对于(II),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的4号染色体上的从
5’端起的第39974850位点为A/G和G/G基因型的种猪个体,淘汰在该位点为A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因G的频率;
对于(III),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的5号染色体上的从
5’端起的第98167490位点为T/C和C/C基因型的种猪个体,淘汰在该位点为T/T基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因C的频率;
对于(IV),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从
5’端起的第16508188位点为G/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(V),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第73358830位点为G/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(VI),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的7号染色体上的从
5’端起的第47604014位点为C/A和C/C基因型的种猪个体,淘汰在该位点为A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因C的频率;
对于(VII),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从
5’端起的第137382277位点为A/G和G/G基因型的种猪个体,淘汰在该位点为A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因G的频率;
对于(VIII),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从5’端起的第72327563位点为C/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(IX),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的10号染色体上的从
5’端起的第63740648位点为G/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(X),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的13号染色体上的从
5’端起的第12703401位点为G/A和G/G基因型的种猪个体,淘汰在该位点为A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因G的频率;
对于(XI),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的14号染色体上的从
5’端起的第131369424位点为G/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(XII),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的15号染色体上的从5’端起的第136409919位点为G/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,对于(I),在所述SEQ ID No.1上的从5’端起的第301位点为T/T基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/T和C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因T的频率;
对于(II),在所述11.1版本国际猪基因组的4号染色体上的从5’端起的第39974850位点为G/G基因型的种猪个体,淘汰在该位点为A/G和A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因G的频率;
对于(III),在所述11.1版本国际猪基因组的5号染色体上的从5’端起的第98167490位点为C/C基因型的种猪个体,淘汰在该位点为T/C和T/T基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因C的频率;
对于(IV),在所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第16508188位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/A和G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(V),在所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第73358830位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/A和G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(VI),在所述11.1版本国际猪基因组的7号染色体上的从5’端起的第47604014位点为C/C基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/A和A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因C的频率;
对于(VII),在所述11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从5’端起的第137382277位点为G/G基因型的种猪个体,淘汰在该位点为A/G和A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因G的频率;
对于(VIII),在所述11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从5’端起的第72327563位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/A和C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(IX),在所述11.1版本国际猪基因组的10号染色体上的从5’端起的第63740648位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/A和G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(X),在所述11.1版本国际猪基因组的13号染色体上的从5’端起的第12703401位点为G/G基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/A和A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因G的频率;
对于(XI),在所述11.1版本国际猪基因组的14号染色体上的从5’端起的第131369424位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/A和G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(XII),在所述11.1版本国际猪基因组的15号染色体上的从5’端起的第136409919位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/A和G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,利用分析所述种猪的核酸的序列来确定所述种猪的如权利要求1中所述的SNP标记,其中所述核酸的序列如SEQ ID No.1所示。
5.一种确定猪肉质性状优劣的方法,所述猪肉质性状为猪肉中总嘌呤含量,所述方法包括:确定所述猪的如权利要求1中所述的SNP标记,并根据所述SNP标记确定所述猪肉质性状:
对于(I),所述猪肉质性状从优到劣,以所述SEQ ID No.1上的从5’端起的第301位点的基因型排序依次为:T/T基因型、C/T基因型和C/C基因型;
对于(II),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的4号染色体上的从5’端起的第39974850位点的基因型排序依次为:G/G基因型、A/G基因型和A/A基因型;
对于(III),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的5号染色体上的从5’端起的第98167490位点的基因型排序依次为:C/C基因型、T/C基因型和T/T基因型;
对于(IV),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第16508188位点的基因型排序依次为:A/A基因型、G/A基因型和G/G基因型;
对于(V),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第73358830位点的基因型排序依次为:A/A基因型、G/A基因型和G/G基因型;
对于(VI),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的7号染色体上的从5’端起的第47604014位点的基因型排序依次为:C/C基因型、C/A基因型和A/A基因型;
对于(VII),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从5’端起的第137382277位点的基因型排序依次为:G/G基因型、A/G基因型和A/A基因型;
对于(VIII),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的9号染色体上的从5’端起的第72327563位点的基因型排序依次为:A/A基因型、C/A基因型和C/C基因型;
对于(IX),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的10号染色体上的从5’端起的第63740648位点的基因型排序依次为:A/A基因型、G/A基因型和G/G基因型;
对于(X),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的13号染色体上的从5’端起的第12703401位点的基因型排序依次为:G/G基因型、G/A基因型和A/A基因型;
对于(XI),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的14号染色体上的从5’端起的第131369424位点的基因型排序依次为:A/A基因型、G/A基因型和G/G基因型;
对于(XII),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的15号染色体上的从5’端起的第136409919位点的基因型排序依次为:A/A基因型、G/A基因型和G/G基因型。