1.一种基于相似性约束的miRNA‑疾病关联预测方法,其特征在于,包括以下步骤:获取miRNA‑疾病关联矩阵、miRNA功能相似性矩阵和疾病语义相似性矩阵;
基于相似性约束的目标函数,将邻接矩阵、miRNA功能相似性矩阵和疾病语义相似性矩阵作为训练数据,自适应学习得到新的miRNA‑疾病关联矩阵。
2.如权利要求1所述的miRNA‑疾病关联预测方法,其特征在于,获取miRNA‑疾病关联矩阵包括:获取miRNA和疾病的关系数据,构建邻接矩阵。
3.如权利要求1所述的miRNA‑疾病关联预测方法,其特征在于,获取疾病语义相似性矩阵包括:
获取疾病语义数据,构建有向无环图,其中,节点表示疾病,节点间的有向边表示疾病之间的层次关系;
采用祖先节点对该节点贡献值的累加和作为该节点的语义值,计算疾病之间的语义相似度,得到疾病语义相似性矩阵。
4.如权利要求1所述的miRNA‑疾病关联预测方法,其特征在于,所述相似性约束的目标函数为:
其中,SM表示新的miRNA功能相似性矩阵,SD表示新的疾病语义相似性矩阵,F表示新的miRNA‑疾病关联矩阵,AM表示miRNA功能相似性矩阵,AD表示疾病语义相似性矩阵,Fi,Fj分别表示第i个miRNA和第j个miRNA与所有疾病的关联向量。
5.一种基于相似性约束的miRNA‑疾病关联预测系统,其特征在于,包括:真实关联数据获取模块,被配置为:获取miRNA‑疾病关联矩阵;
相似性矩阵获取模块,被配置为:获取miRNA功能相似性矩阵和疾病语义相似性矩阵;
自适应学习预测模块,被配置为:基于相似性约束的目标函数,将邻接矩阵、miRNA功能相似性矩阵和疾病语义相似性矩阵作为训练数据,自适应学习得到新的miRNA‑疾病关联矩阵。
6.如权利要求5所述的miRNA‑疾病关联预测系统,其特征在于,获取miRNA‑疾病关联矩阵包括:获取miRNA和疾病的关系数据,构建邻接矩阵。
7.如权利要求5所述的miRNA‑疾病关联预测系统,其特征在于,获取疾病语义相似性矩阵包括:
获取疾病语义数据,构建有向无环图,其中,节点表示疾病,节点间的有向边表示疾病之间的层次关系;
采用祖先节点对该节点贡献值的累加和作为该节点的语义值,计算疾病之间的语义相似度,得到疾病语义相似性矩阵。
8.如权利要求5所述的miRNA‑疾病关联预测系统,其特征在于,所述相似性约束的目标函数为:
其中,SM表示新的miRNA功能相似性矩阵,SD表示新的疾病语义相似性矩阵,F表示新的miRNA‑疾病关联矩阵,AM表示miRNA功能相似性矩阵,AD表示疾病语义相似性矩阵,Fi,Fj分别表示第i个miRNA和第j个miRNA与所有疾病的关联向量。
9.一种电子设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述程序时实现如权利要求1‑4任一项所述的miRNA‑疾病关联预测方法。
10.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,该程序被处理器执行时实现如权利要求1‑4任一项所述的miRNA‑疾病关联预测方法。