1.一种猪的SNP标记,所述SNP标记包括如下SNP标记中的至少一种:(I)含有所述SNP标记的核酸的序列如SEQ ID No.2所示,所述SNP标记位于SEQ ID No.2上的从5’端起的第301位点,对应于11.1版本国际猪基因组的1号染色体上的从5’端起的第242759760位点,为A或G;
(II)含有所述SNP标记的核酸的序列如SEQ ID No.3所示,所述的SNP标记位于SEQ ID No.3上的从5’端起的第301位点,对应于11.1版本国际猪基因组的2号染色体上的从5’端起的第118218417位点,为C或CCAT;
(III)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的3号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的3号染色体上的从5’端起的第125720803位点,为C或T;
(IV)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第1309595位点,为C或T;
(V)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的8号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的8号染色体上的从5’端起的第127473136位点,为C或A;
(VI)含有所述SNP标记的核酸的序列位于11.1版本国际猪基因组的10号染色体上,所述SNP标记位于11.1版本国际猪基因组的10号染色体上的从5’端起的第1479247位点,为G或A。
2.如权利要求1所述的SNP标记在确定猪或猪肉中总嘌呤含量高低中的应用。
3.一种猪的遗传改良的方法,所述方法包括:确定种猪核心群中的种猪的如权利要求1所述的SNP标记,并根据所述SNP标记做出相应的选择:对于(I),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No.2上的从5’端起的第301位点为A/G和G/G基因型的种猪个体,淘汰在该位点为A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因G的频率;优选在所述SEQ ID No.2上的从5’端起的第301位点为G/G基因型的种猪个体,淘汰在该位点为A/G和A/A基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因G的频率;
对于(II),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No.3上的从5’端起的第301位点为C/CCAT和CCAT/CCAT基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因CCAT的频率;优选在所述SEQ ID No.3上的从5’端起的第301位点为CCAT/CCAT基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/CCAT和C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因CCAT的频率;
对于(III),在所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的3号染色体上的从5’端起的第125720803位点为C/T和T/T基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因T的频率;优选在所述11.1版本国际猪基因组的3号染色体上的从5’端起的第125720803位点为T/T基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/T和C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因T的频率;
对于(IV),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从
5’端起的第1309595位点为C/T和T/T基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因T的频率;优选在所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第1309595位点为T/T基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/T和C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因T的频率;
对于(V),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的8号染色体上的从5’端起的第127473136位点为C/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;优选在所述11.1版本国际猪基因组的8号染色体上的从5’端起的第127473136位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/A和C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(VI),所述种猪核心群中选择在所述11.1版本国际猪基因组的10号染色体上的从
5’端起的第1479247位点为G/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;优选在所述11.1版本国际猪基因组的10号染色体上的从5’端起的第1479247位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/A和G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,利用分析所述种猪的核酸的序列来确定所述种猪的如权利要求1所述的SNP标记,其中所述核酸的序列选自如SED ID No.2和/或SED ID No.3所示的序列。
5.一种确定猪肉质性状优劣的方法,所述方法包括:确定所述猪的如权利要求1所述的SNP标记,并根据所述SNP标记确定所述猪肉质性状:对于(I),所述猪肉质性状从优到劣,以所述SEQ ID No.2上的从5’端起的第301位点的基因型排序依次为:G/G基因型、A/G基因型和A/A基因型;
对于(II),所述猪肉质性状从优到劣,以所述SEQ ID No.3上的从5’端起的第301位点的基因型排序依次为:CCAT/CCAT基因型、C/CCAT基因型和C/C基因型;
对于(III),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的3号染色体上的从5’端起的第125720803位点的基因型排序依次为:T/T基因型、C/T基因型和C/C基因型;
对于(IV),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第1309595位点的基因型排序依次为:T/T基因型、C/T基因型和C/C基因型;
对于(V),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的8号染色体上的从5’端起的第127473136位点的基因型排序依次为:A/A基因型、C/A基因型和C/C基因型;
对于(VI),所述猪肉质性状从优到劣,以所述11.1版本国际猪基因组的10号染色体上的从5’端起的第1479247位点的基因型排序依次为:A/A基因型、G/A基因型和G/G基因型。
6.一种改善猪肉品质的猪新品系和/或猪新品种建立的方法,其包括如下步骤:对于如权利要求1所述SNP标记的基因型为(I)A/G或A/A的猪,通过定点突变将其中的A/G和A/A突变为G/G基因型;
(II)C/CCAT和C/C的猪,通过定点突变将其中的C/CCAT和C/C突变为CCAT/CCAT基因型;
(III)C/T和C/C的猪,通过定点突变将其中的C/T和C/C突变为T/T基因型;
(IVC/T和C/C的猪,通过定点突变将其中的C/T和C/C突变为T/T基因型;
(V)C/A和C/C的猪,通过定点突变将其中的C/A和C/C突变为A/A基因型;
(VI)G/A和G/G的猪,通过定点突变将其中的G/A和G/G突变为A/A基因型。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,利用转基因的方法或基因编辑的方法进行突变。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,利用CRISPR/Cas9的基因编辑方法进行突变。