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专利号: 2023107720587
申请人: 安徽农业大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
专利领域: 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
更新日期:2024-04-29
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.一种用于水芹遗传多样性分析的SSR分子标记引物组,其特征在于:包括以下33对引物:如序列表中SEQ ID No.1‑2所示的核苷酸序列的引物Oj‑005‑F、Oj‑005‑R;

如序列表中SEQ ID No.3‑4所示的核苷酸序列的引物Oj‑012‑F、Oj‑012‑R;

如序列表中SEQ ID No.5‑6所示的核苷酸序列的引物Oj‑013‑F、Oj‑013‑R;

如序列表中SEQ ID No.7‑8所示的核苷酸序列的引物Oj‑031‑F、Oj‑031‑R;

如序列表中SEQ ID No.9‑10所示的核苷酸序列的引物Oj‑032‑F、Oj‑032‑R;

如序列表中SEQ ID No.11‑12所示的核苷酸序列的引物Oj‑039‑F、Oj‑039‑R;

如序列表中SEQ ID No.13‑14所示的核苷酸序列的引物Oj‑069‑F、Oj‑069‑R;

如序列表中SEQ ID No.15‑16所示的核苷酸序列的引物Oj‑071‑F、Oj‑071‑R;

如序列表中SEQ ID No.17‑18所示的核苷酸序列的引物Oj‑072‑F、Oj‑072‑R;

如序列表中SEQ ID No.19‑20所示的核苷酸序列的引物Oj‑077‑F、Oj‑077‑R;

如序列表中SEQ ID No.21‑22所示的核苷酸序列的引物Oj‑078‑F、Oj‑078‑R;

如序列表中SEQ ID No.23‑24所示的核苷酸序列的引物Oj‑079‑F、Oj‑079‑R;

如序列表中SEQ ID No.25‑26所示的核苷酸序列的引物Oj‑080‑F、Oj‑080‑R;

如序列表中SEQ ID No.27‑28所示的核苷酸序列的引物Oj‑081‑F、Oj‑081‑R;

如序列表中SEQ ID No.29‑30所示的核苷酸序列的引物Oj‑084‑F、Oj‑084‑R;

如序列表中SEQ ID No.31‑32所示的核苷酸序列的引物Oj‑085‑F、Oj‑085‑R;

如序列表中SEQ ID No.33‑34所示的核苷酸序列的引物Oj‑091‑F、Oj‑091‑R;

如序列表中SEQ ID No.35‑36所示的核苷酸序列的引物Oj‑101‑F、Oj‑101‑R;

如序列表中SEQ ID No.37‑38所示的核苷酸序列的引物Oj‑108‑F、Oj‑108‑R;

如序列表中SEQ ID No.39‑40所示的核苷酸序列的引物Oj‑110‑F、Oj‑110‑R;

如序列表中SEQ ID No.41‑42所示的核苷酸序列的引物Oj‑112‑F、Oj‑112‑R;

如序列表中SEQ ID No.43‑44所示的核苷酸序列的引物Oj‑115‑F、Oj‑115‑R;

如序列表中SEQ ID No.45‑46所示的核苷酸序列的引物Oj‑119‑F、Oj‑119‑R;

如序列表中SEQ ID No.47‑48所示的核苷酸序列的引物Oj‑120‑F、Oj‑120‑R;

如序列表中SEQ ID No.49‑50所示的核苷酸序列的引物Oj‑121‑F、Oj‑121‑R;

如序列表中SEQ ID No.51‑52所示的核苷酸序列的引物Oj‑125‑F、Oj‑125‑R;

如序列表中SEQ ID No.53‑54所示的核苷酸序列的引物Oj‑131‑F、Oj‑131‑R;

如序列表中SEQ ID No.55‑56所示的核苷酸序列的引物Oj‑140‑F、Oj‑140‑R;

如序列表中SEQ ID No.57‑58所示的核苷酸序列的引物Oj‑142‑F、Oj‑142‑R;

如序列表中SEQ ID No.59‑60所示的核苷酸序列的引物Oj‑146‑F、Oj‑146‑R;

如序列表中SEQ ID No.61‑62所示的核苷酸序列的引物Oj‑150‑F、Oj‑150‑R;

如序列表中SEQ ID No.63‑64所示的核苷酸序列的引物Oj‑156‑F、Oj‑156‑R;

如序列表中SEQ ID No.65‑66所示的核苷酸序列的引物Oj‑159‑F、Oj‑159‑R。

2.一种如权利要求1所述的SSR分子标记引物组在水芹遗传多样性分析和种质资源遗传系谱分析中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述水芹遗传多样性分析及种质资源遗传系谱分析的方法,包括以下步骤:(1)提取待检测的水芹材料的DNA样品;

(2)以步骤(1)提取的DNA样品为模版,采用所述SSR分子标记引物组对DNA样品进行PCR扩增,获得PCR产物;

(3)将步骤(2)所获得的PCR产物用琼脂糖凝胶电泳检测,并统计条带检测结果;

(4)根据步骤(3)所统计的条带检测结果进行水芹遗传多样性分析和种质遗传系谱分析。

4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:在步骤(2)中,PCR扩增采用的反应体系,包括10μl 的2×PCR Mix,1μl的正向引物,1μl的反向引物,1μl的稀释好的DNA模板,7μl 的ddH2O,总体积20μl。

5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:在步骤(2)中,PCR反应程序如下:94℃预变性3 min;94℃变性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸6 s,30个循环;72℃延伸10 min,4℃保存。

6.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:在步骤(4)中,水芹遗传多样性分析和种质遗传系谱分析方法具体为,使用Power Marker和GenAlEx软件分析SSR扩增数据,计算多态信息含量、次等位基因频率、等位基因数、有效等位基因数、遗传多样性、期望杂合度的数据,并采用NTsys‑pc计算水芹材料之间的遗传距离和遗传相似系数,使用SAHN构建UPGMA聚类树。